动物肠道菌群在动物营养和健康方面具有极为重要的作用。动物出生之后，动物肠道可以在很短的时间内建立起一个相对稳定的菌群结构，这种相对稳定的平衡状态保证了其肠道的正常消化与吸收功能。更为重要的是，正常而稳定的菌群结构对肠道内壁黏膜提供了重要的保护屏障，有效地抑制了病原菌在消化道的定植，保证了动物的健康。

     外部条件发生变化时，如食料出现重大改变，或抗生素的不当使用等，肠道菌群的结构平衡就可能发生改变，某些有害菌株或类群的相对或绝对数量出现增加，可能影响肠道的消化吸收功能，造成肉料比下降和日增重减少；或者降低动物的免疫力，易发疾病，最终给养殖户带来经济损失。以断奶仔猪为例，仔猪出生后数小时内肠道细菌开始定植，肠道菌群动态结构迅速建立；但在断奶前后，仔猪饮食结构的重大改变，造成肠道菌群结构明显变化，如菌群多样性增加，某些菌群减少甚至消失，另一些菌群则显著增加。断奶前后出现腹泻的仔猪，其肠道菌群的DNA分析可发现一些特异性条带。

     通过饮食干预调节动物的肠道菌群，提高动物的消化吸收、免疫抗病能力是可行的。例如许多研究表明，酸化剂、益生菌、中药制剂、膳食纤维、低聚糖等都可能预防和减轻猪的腹泻，促进仔猪以及大中猪的健康生长。酸化剂和益生菌可抑制肠道病原菌的定植和生长、改善肠道菌群结构、提高动物免疫能力，起到保健乃至治疗作用。虽然它们已经广泛地应用于养猪业，但由于研究条件的限制，大多数相关研究主要集中在这些制剂对猪的生长性能影响方面，而对猪肠道菌群的分子微生态学、免疫能力提高的机理研究等方面则相对较少、不够深入，利用酸化剂或益生菌替代或部分替代抗生素尚难以稳定实现。一旦中国对畜禽用抗生素的使用更加严格，养殖业可能会通过大规模使用酸化剂或益生菌来替代抗生素（从长远来看则需要提高我国养殖管理总体水平来解决），届时，有关动物肠道微生态的基础研究将十分迫切。

     总体而言，全球对动物肠道菌群的分子微生态学大数据尚未建立，基础与应用研究都不够透彻。肠道菌群研究的主要技术方法有生长性能对比、温度梯度凝胶电泳、变性梯度凝胶电泳、荧光原位杂交、实时定量PCR、末端限制性片段长度多态性、高通量测序等。其中高通量测序是研究肠道菌群比较前沿的方法，所能反映的数据量也远远大于其他方法，但目前其成本相对较高，且对生物信息分析能力要求较高，因此采用该法研究动物肠道菌群的文献还不多。中国作为全球养殖大国，未来国家、行业龙头应提高在这方面的科研投入，利用这些知识必能减少动物疾病的发生、提高饲料转化率、控制抗生素的不当使用，从而提高我国养殖业的总体水平。

(陈峰)