真菌的分子生物学鉴定方法
徐越 四川农业大学
真菌的核糖体DNA是由核糖体基因及与之相邻的间隔区组成，其基因组序列从5’到3’依次为:外部转录间隔区 (externaltranscribedspacer，ETS)、 185基因、内部转录间隔区 1(internaltranseribedspacer，ITSI)、5.55基因、内部转录间隔区2(xTsZ)、285基因和基因间隔序列 (intergeniespaeer，IGs)。
真菌核糖体DNA中的 185、 5.85和285的基因组序列在大多数生物中趋于保守，在生物种间变化小。而核糖体DNA中的ITS区受外界环境因素的影响较小，与编码区域相比具有进化速度慢的特点，在种内不同菌株之间高度保守，而在真菌种间存在极大变化，表现出极大的序列多态性，可为真菌学研究提供丰富遗传信息。
众多畜牧人的研究表明ITs区域差异大于l%就可能代表不同的种，但不同属的情况可能会有所不同。 Gloriascorzetti等人研究表明，c.magnus、F‘magnus和F.floriforme的 265rRNADl/D2区基因序列是完全相同的，只通过这段基因序列分析无法区分这三个种，但是在5.85一ITS区序列存在很大的差异，通过5.85一ITs区序列分析可以被很好的区别。汪碧涵等通过比对 rDNADl/DZ和ITs序列绘制的9种红色酵母的系统发育树，发现ITS区域的变异性高于Dl/DZ序列，但二者结论一致，说明利用ITS区域的序列分类真菌的属、种以下水平是可行的。彭帮柱等利用ITsl一5.85一ITsZ区，进行扩增，鉴定了一株用于发酵柿子酒的微生物，结果表明该菌株为酿酒酵母 saeeharomyeeseerevisiae。方华，曹任等应用真菌ITsrDNA通用引物ITSI和ITS4扩增整个ITS序列(包括ITSI和ITS2)鉴定了从黄酒麦曲中分离出了真菌，经测序和序列比对，这5株菌分别为伞枝犁头霉 (Absidiacorymbifera)、微小毛霉 (Rhizomueorpusillus)、米曲霉 (Aspergillusorgyze)、烟曲霉(Aspergillusfumigatus)、米根霉。
很多学者还研究了植物中的致病真菌的ITS区，并将其作为鉴定致病性真菌的有效手段之一。陈怀谷等对7个从江苏省小麦纹枯病样本分离到的丝核菌菌株的ITS序列进行分析，得到与这些菌株亲缘关系最近的菌株序列，并明确了这些菌株的分类地位。高永洋，高观朋等采用真菌核糖体基因转录间隔区域 (ITS)通用引物，PcR扩增3株不同的黄瓜黑星病茵核糖体基因的ITS序列，并对PCR产物进行测序和序列分析，结果表明，这3株真菌为瓜疮痴枝抱霉 cladosPoriumcucumerinu。所以，利用真菌的ITS片段，对真菌进行分子鉴定，并研究其系统发育是十分有价值的。
上一篇： 高效养羊的具体实施措施
下一篇： "以养为主"成气候 ——广西钦州渔业养殖跨越发展纪实
