长期使用抗生素，会使细菌或病毒产生抗药性，家畜、家禽的机体也会相应产生耐药性，从而使得药效越来越差。过度、大量使用抗生素，虽然可以对病原菌进行抑制，但与此同时也杀灭了体内的有益菌群，微生物平衡也被破坏，造成了条件性致病菌过度繁殖，最终导致内源性感染或继发感染。长期使用抗生素，还会降低畜禽体内细胞免疫功能，使其无法对疫苗产生足够有效的免疫应答，从而使疫苗失效，造成免疫失败。长期过量使用抗生素，造成在产品中产生有害物质的蓄积，严重威胁着人类的身体健康。

     随着畜禽业的快速发展，规模化养殖场的饲养密度也不断增大，为提高生产效率，生产周期也随之变短，以及在每个时期畜禽的生理特点不同，因而对药物的吸收、代谢、排泄结果也不一致。药物只有接触畜禽体内的病原微生物才能发挥作用，因此应根据畜禽生理状况、饲养场所的环境条件、药物对机体功能代谢及形态引起的变化等选择不同的用药途径，才能起到应有的疗效。

     抗菌药中氯霉素、苯唑青霉素、邻氯青霉素、氨苄青霉素都可用于革兰氏阳性菌引起的感染，对革兰氏阳性菌引起的疾病有效。氨基糖苷类抗生素、脲基青霉素类、喹诺酮等主要对革兰氏阴性菌引起的疾病有效。磺胺类主要对大多数革兰氏阳性、阴性细菌如链球菌、沙门氏菌有较高的抑制作用。对于畜禽的病毒性疾病选用盐酸吗啉胍、病毒唑或金刚烷胺，但此时使用抗菌类药只能控制细菌病继发感染。所选择的药物应为正规兽药生产企业生产，带有批准文号。对于国家明令禁止或淘汰的兽药不得使用，并在使用前认真阅读说明书，以达到对症、高效、低毒、安全的用药效果，并仔细查看生产日期和有效期。

     任何药物都有一定的副作用，在生产实际中应严格掌握剂量和疗程，要保证剂量和疗程的合理性，不得擅自增加用量或延长用药时间。另外，当采用饮水或拌料给药时，一定要注意混合均匀，防止药物中毒及损伤脏器。一般首次用量可稍大些，之后恢复正常，以缩短和减少抗药性的产生。对于影响畜禽免疫力药物，在免疫前后应慎用。对于影响生产性和可能在体内长期残留的药物，如磺胺类等。要注意药物使用对象、使用期和休药期，特别是肉用畜禽使用抗球虫药等毒力较大的药物。一般上市前15~20天停药。此外，每种兽药都有最佳的使用方法，不得任意更改，以免影响药效。

     为了发挥药物的协同作用，避免产生毒副作用，延缓耐药性的产生，经常采用联合用药。如抗菌增效剂甲氧苄胺嘧啶（TMP）与磺胺类药物联合使用，青霉素与链霉素联合应用，既可使抗菌范围扩大，又能使药效得以提高，但在使用过程中，应注意配伍禁忌，以避免发生拮抗反应，使药效降低。

     交替用药，以防耐药。大量或长期使用同一种广谱抗生素，极易导致耐药性的产生，不但药效降低，还会使得一些对本药不敏感的细菌病原体大量繁殖，造成二重感染。因此，在选择药物前，最好先对所分离的病原菌进行药敏试验，选择2~3种高敏药物交替使用，切勿长期使用同种药物。

     饲料药物添加剂为长期添加使用，容易产生耐药性，或是药物残留在机体内，甚至蓄积中毒。因此要严格按照农业部《允许作饲料药物添加剂的兽药品种及使用规定》。科学、合理、准确选择使用饲料药物添加剂，不但要保证禽类健康和畜产品质量，还应注意可能给环境造成的污染。

     近年来，随着人们健康饮食方面意识的提高，对畜产品要求也越来越高，如优质、绿色、无药物残留等。而传统的用药方法，不仅不能满足这一要求，而且使畜禽疾病越来越复杂，越来越难防治。于是一些微生态制剂得到了快速开发利用，如饲用酶制剂、中草药等。不仅高效、无毒、无抗药性、无残留，而且能够使胃肠道等体内环境得到调节，促进消化吸收和机体生长发育，还可改善、净化饲养环境，增强机体免疫力，减少应激和疫病发生。但应特别注意使用微生态制剂的同时，禁止使用抗生素。