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中国兽医药品监察所OIE猪瘟参考实验室:我国猪瘟流行病学及数据库研究

    猪瘟病毒分子流行病学研究的科学意义,在于实时跟踪CSFV的变异特征及抗原性变异程度,监测新的CSFV流行毒株的情况和疫苗对流行毒株的有效性。通过分析我国自1979年到2016获得和收集的868条E2基因主要抗原区域序列(190bp)( 含中国台湾地区的49条 ),中国流行的CSFV分属为Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ三个基因型,1.1、2.1、2.2、2.3和3.4五个基因亚型。

    经分析中国大陆的819条E2基因序列,74.24%属于基因Ⅱ型,其中2.1亚型为499条,占60.93%;1.1亚型为211条,占25.76%;其他为少量的2.2 和2.3亚型分别为93条(11.36%)和16条(1.95%);中国台湾地区存在基因Ⅲ型。全国各省市自治区均存在基因Ⅱ型,表明基因Ⅱ型在中国CSF流行中占绝对优势,属优势基因型。

    序列比对分析研究还发现中国CSFV流行株基因组在37年间处于稳定状态。监测结果还表明,到目前为止,中国大陆一直没有监测到基因Ⅲ型的传入与流行,但周边国家及中国台湾地区存在其他亚型毒株,如韩国存在3.2亚型、泰国存在3.3亚型、中国台湾和日本存在3.4亚型毒株。因此,要警惕周边国家及地区的新亚型流行毒株传入我国大陆。

    我们采用上述CSFV流行病学数据,与数据库、GIS(地理信息系统)、生物信息学技术相结合,创建了我国第一个猪瘟流行病学信息系统(CSFinfo),包含1 000株中国流行毒株、868条CSFV E2基因序列和其他序列,成为全球继德国之后第二个拥有这种数据库的国家。对CSFV流行病学监测提供了重要技术平台,为政府提供可靠的疫情资料。

    中国兽医药品监察所国家猪瘟参考实验室是由农业部2002年公布的第一批国家参考实验室,2017年6月1日,世界动物卫生组织(OIE)确认中国兽医药品监察所猪瘟实验室成为新的OIE猪瘟参考实验室,该实验室是国内最早开展猪瘟(Classical Swine Fever,CSF)研究的权威实验室之一。

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