在影响养猪效益的诸多因素中，种猪性能起主导作用。按美国农业部（USDA）1996年对美国50年来畜牧业中各类科学技术所起的作用进行总结，遗传育种占了40%的贡献率。据美英等发达国家和联合国粮食及农业组织（FAO）的预测，21世纪全球商品化生产的畜禽品种将通过分子育种技术进行培育，品种对动物生产的贡献率亦将超过50%。我国养猪业经过50多年的发展，特别是改革开放以来取得了优良的成绩，猪的育种工作也取得了很大的进步。但是，我国的养猪业与发达国家相比仍有较大差距。出栏率、胴体重以及母猪头均年提供商品猪头数和猪肉量仍不高，这与育种工作不够先进有很大关系。

    发达国家的养猪业不仅完成了由脂肪型向瘦肉型猪种的转变，而且猪种的品质已获得明显改善。大白猪、长白猪和杜洛克猪等瘦肉型猪种在世界范围内被广泛生产和利用。同时，随着猪育种技术的进步和市场向多元化方向发展，猪专门化品系的培育和配套利用成为世界养猪业发展的主导方向。目前国外猪育种公司推出的配套系及国内种猪企业新育成通过审定的配套系，多数是利用大白猪、长白猪、杜洛克猪等品种选育而成的。

    国外育种体系可划分为3种模式：第1种是国家育种体系，典型代表是丹麦，丹麦国家猪生产委员会NCPP（TheNationalCommitteeForPigProduction）组织实施了丹麦种猪育种计划（DanishPigBreedingProgram），简称“丹育”；第2种是大型跨国公司，典型企业代表是PIC；第3种是介于两之间的育种企业。

    生产性能测定与遗传评估是猪育种工作的重点，在测定基础上选种是育种工作的核心措施，遗传评估是选种的依据。1972年我国成立“全国猪育种科研协作组”，该协作组所属的猪品系繁育专题研究协作组开展过多项活动，有力推动着猪品系培育工作的发展。从1997年开始，全国畜牧总站和中加瘦肉型猪项目组合作，在全国开展种猪测定与遗传评估培训；2000年3月，全国畜牧总站发布了《全国种猪遗传评估方案（试行）》，标志着种猪遗传评估工作在我国全面展开；2004年成立全国种猪遗传评估中心，开展全国种猪遗传评估系统建设，此后参与全国种猪遗传评估系统的种猪企业越来越多，测定数量逐年增加。

    丹系长白、大白的窝产仔数分别达到14头和13头时，仔猪初生重下降、死胎明显增加，加之欧盟1999年起禁止在饲料中添加抗生素，哺乳仔猪的成活率相对不高。研究发现，在哺乳期，仔猪95%的死亡发生在出生后的前5d。2000年，丹育将长白、大白的繁殖性能、育种目标性状确定为LP5（产后5d的活仔数），其遗传力为0.13。通过选择LP5，提高产活仔数和断奶仔猪成活率。2004年，丹育再一次调整了父系猪和母系猪的选择标准，母系猪LP5的期望遗传进展为每世代0.43头，而且同时在BLUP（一种先进的动物育种值估计方法）综合选择指数中也增加了屠宰率指标。

    丹育育种场公猪的选择强度为2%，几乎100%采用人工授精，受胎率达90%以上。人工授精站公猪纯繁的利用时间平均仅为6个月左右，年淘汰率达130%，并明确规定：不论该公猪多么优秀，每头公猪纯繁与配母猪数量不能超过本品种母猪存栏量的5%~8%，目的为控制近交系数的增长。母猪的选择强度为10%左右。每年完成生长性能测定的种猪超过10万头，每年长白、大白扩繁群统计有超过10万窝的繁殖记录，从而极大地提高了遗传评估的准确性和选种的准确度。核心群母猪的更新率也非常高，达60%~70%，极大地缩短了世代间隔，加快了种猪的遗传改良速度。

    种猪测定分中心测定与场内测定2个水平进行。Bogildgard中心测定站采用种猪自动计料饲喂系统ACEMA128，当体重达到75kg以上，采集肉样送至实验室进行肉质测定（主要测定肌内脂肪含量、pH值、肉色）。当体重达到100kg时，测定个体日增重、饲料转化率、活体背膘厚，计算瘦肉率，同时进行体型评分。场内测定：开测体重为30kg（25~35kg），至92kg（75~105kg）时结测，测定日增重、活体背膘厚，并计算瘦肉率，同时进行体型评分。中心测定与场内测定的数据再通过网络传送至丹育计算机中心，完成综合指数的计算。采用BLUP法计算性状的EBV（育种估计值），然后根据性状的经济加权系数计算每头猪的综合指数及次级指数（SUB—INDEX）。丹麦还采用无特定病原法（SPF）进行种猪生产，以提高种猪的健康水平和质量。

    专门化品系选育和配套系猪生产是当今世界猪育种的一个主要方向。猪配套系是养猪业的发展趋势，生产配套系商品肉猪是高效养猪的必然选择。

    自1991年引进美国迪卡配套系之后，到目前为止，国外一些配套系猪已经落户我国，如：英国PIC种猪、法国伊比得种猪、比利时斯格种猪及荷兰达兰配套系种猪，其生产性能和经济效益都很高，尤其适合于规模化饲养，并且随着生产和市场的变化，不断推出的新的配套组合，促进了我国配套系猪的育种工作。1998年7-8月，由深圳光明畜牧合营有限公司培育的光明猪配套系和深圳市农牧实业有限公司培育的深农猪配套系通过国家畜禽品种审定委员会审定。这标志着我国从此拥有自己的猪配套系。截至2013年9月，经国家审定通过的猪配套系共有10个：除上述两个配套系外，还有冀合白猪配套系、中育猪配套系01号、华农温氏猪配套系、滇撒猪配套系、鲁农1号猪配套系和渝荣1号猪配套系、天府肉猪配套系及川藏黑猪配套系。这些配套系可分为3类：第1类是各亲本系均是引入品种；第2类是在母系中加入地方猪基因；第3类则是亲本系中的母系采用从地方品种中经纯繁选育出的专门化品系，如滇撒猪配套系中的母本是纯种地方猪——撒坝猪种，经13年（1993-2005）选育出来的专门化品系。

    1）育种目标。猪的育种目标一方面是提高种群生产性能的遗传潜力；另一方面是如何最大可能地实现这些遗传潜力，实现养猪生产与加工的最大经济效益。育种目标是由市场和消费需求共同决定的，原世界猪育种目标主要考虑3个性状，即瘦肉率、饲料效率和生长速度，后加入产仔数，1996-2000年期间又增加了肉质性状，在此基础上，现在的育种目标（2000-2005年）中，又考虑了抗病力。

    2）品系选育和多系配套。配套系猪就是不同的专门化品系（突出主要性状，兼顾其他性状）通过配合力测定，然后杂交配套生产出增长速度快、饲料报酬高、肉质优良和适合市场需求的商品猪。配套系猪不是一个品系，而是为特定杂交体系所选择和培育的几个品系的组合。各种配套组合能够灵活地根据市场需求的变化而进行更新，通过配套杂交优势的发挥，实现养猪最大的经济效益，从而达到优质高效可持续发展的目标。

    3）育种技术体系。育种技术体系为常规育种技术和分子标记辅助选择相结合的技术体系。采用新设备（超声波技术、计算机图像分析系统和种猪性能测定自动化系统）提供新的选育指标：活体膘厚、眼肌面积、采食能力、饲料利用效率和不同时期的生长速度，对猪的遗传改良产生了重要影响。开展大规模的生产性能测定，采用动物模型BLUP法（最佳线性无偏估计）进行种猪的遗传评估，结合分子标记辅助选择或标记辅助导入，选育各具特色的专门化品系。通过人工授精技术快速推广优秀的种猪基因，逐步建立起瘦肉型猪持续改良的良种繁育体系。

    4）分子标记辅助选择。即利用与重要生产性状作为连锁的DNA标记信息来评估动物个体相关性状的遗传素质和生产潜力，对特定性状进行选择，实现动物的遗传改良。分子标记辅助选择技术是一种快速、准确、有效的补充选择手段，但我们也应该看到分子育种的不足，并不是所有性状的改良都可以通过分子育种来实现，如当性状的遗传力较高时，常规的表型选择和BLUP方法即可获得较好的效果。目前看来，分子标记辅助育种技术还不成熟、不完善，只有与常规育种相结合，才能较好地发挥作用。因此，利用分子标记辅助选择技术得到的优异种质仍要通过常规育种方法选择培育，才可真正应用于育种工作，在生产上产生经济效益。目前，氟烷基因、酸肉基因（影响肉质性状的基因）、雌激素受体基因（影响繁殖性状的基因）及类胰岛素生长因子2基因（影响生长与瘦肉率、整齐度的基因）等已在猪育种中应用。

    标记辅助育种目前还有很多尚未解决的问题，其实际应用还非常有限，但随着分子遗传学和分子生物技术的继续深入发展，分子育种将成为未来猪育种的一种重要方法，标记辅助育种的应用必定会越来越普遍，且其优越性也将逐渐显露出来。