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贵州省是中国家禽遗传资源较为丰富的地区之一,但近年来由于生存环境遭到破坏、引进外地品种杂交改良等人为因素及某些自然因素的影响,贵州地方鸡品种的开发利用受到限制,且对品种间及群体内的遗传变异目前还不是很清楚(包文斌等,2008;傅筑荫,2000)。因此认识贵州地方鸡品种遗传多态性是保护利用地方鸡种资源的前提,为进一步选育和杂交配套提供理论基础,还可探讨人工选择对同一个地理群体遗传分化的影响。动物线粒体DNA控制区非编码基因区,在进化过程中受环境的选择压力小,表现出进化速率快和母系遗传等特点,在鸟类的分类研究中常用作种系发生的分子标记(黄族豪等,2006,2008;李吉均等,1979;刘益平等,2004;潘周雄等,2008)。本试验通过比较分析6个贵州地方鸡品种mtDNA序列变异,对贵州地方鸡品种的遗传多态性进行研究,以期能够对这些地方品种群体间的遗传分化有更好的了解。
经测序得到的6个贵州地方鸡种mtDNA D-loop部分序列富含碱基A+T,而C含量相对较高,表现出序列碱基组成的偏倚性。这与鸟类mtDNAD-loop区富含A+T的报道(Randi等,1998;Rozas等,1999;Tamura等,2007)相一致。位点变异统计显示在40个变异位点中,转换占到32个,颠换只有7个,且瑶山鸡群体中未发现颠换现象,这表明6个贵州地方鸡种mtDNA的进化具有较高的保守性。
试验中6个贵州地方鸡种群体内单倍型多样度的差异较大,总体上单倍型多样度丰富,与较高的位点变异率一致。从此结果推断贵州地方鸡种在长期的进化过程中可能受到多方向的选择。试验基于Kimura双参数模型构建的NJ分子系统进化树中,百宜黑鸡与绿壳蛋鸡聚在一起,瑶山鸡、黔东南小香鸡和柳源土鸡聚在同一类群。由此可推断贵州地方鸡种可能来源于不同分化的群体,具有多个独立母系。原因可能是红色原鸡在不同的时间不同的地方被多次独立驯化,与长期的人类活动及地质条件变化相关。
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