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中药材是我国的瑰宝。随着畜牧业的发展，中药材也逐渐应用到畜禽养殖上来。中兽药制剂生产逐渐成为一个新兴的产业，前景广阔。但目前，我国中兽药制剂发展仍存在诸多问题，比如生产厂家少、设备落后，缺人才、缺技术等，远远不能满足动物养殖业发展的需要。当前中兽药制剂生产中存在的主要问题，表现在以下几个方面。
1.中兽药制剂产品剂型单一。目前兽医临床上使用的中兽药制剂产品除少量的注射剂之外，大多数为散剂（粉剂），拌料口服。广大用户认为中兽药制剂产品剂型单调，粗制滥造，包装体积过大，用药量大，用量不好掌握，适口性差，运输保管不方便。希望生产厂家对中兽药制剂产品要加大科技创新力度，改造制型，增大科技含量，稳定质量，提高防控效果，为我国有五千多年发展历史的中药增添辉煌。
2.盲目地搞中西药混合制剂。有少数兽药厂家任意地改变药方，擅自在黄芪多糖注射液、柴胡注射液、板蓝根注射液及鱼腥草注射液中盲目地加入氨基比林、安乃近、肾上腺素或抗生素等，搞什么中西医结合复方制剂，宣扬治疗猪的高热病一针见效。但在临床上使用后，治疗的当天病猪体温下降，但到第二天体温又继续升高，而且病情变得更加严重，结果加快病猪的死亡，死亡率上升。中西药的结合要有科学性，经受兽医临床的检验，不是随意地把几种中药加上西药混合在一起就成了中西医结合的药方，毫无科学依据。
3.中兽药制剂产品质量不稳定，高科技含量不高。中兽药制剂产业的生产水平与其他产业相比，其高科技含量不高。由于目前中兽药制剂产品没有国家标准，缺乏科学的定性与定量方法，中药材分子鉴定与提纯技术、浓缩技术、超微粉技术以及质量检测技术等滞后，生产质量控制问题很难解决。加上生产设备落后，程序化、自动化程度不高，生产工艺参数与参数的控制达不到客观要求。因此，造成目前兽药市场上中兽药制剂品种多而杂，质量不稳定，同一个厂家生产的产品不同批次之间质量也不稳定，不同厂家生产的同一品种的质量相差很大，这不仅影响到兽医临床上使用的防治效果，也严重地影响到动物用的中兽药制剂产品的生产与发展。
4.在中兽药制剂产品中蓄意掺假，欺骗用户。有的中兽药制剂生产厂家在其生产的中兽药散剂的包装上标明添加有免疫增强因子、增食因子、促生长剂及抗应激剂等字样，以此扩大其中兽药制剂的作用效果，引诱用户购买。这实质上是蓄意造假、欺骗用户的一种营销手段。还有的生产厂家在出售的黄芪颗粒粉使用说明书上标明黄芪含量为65%，经药检部门检查，发现其产品中实际黄芪的含量只有20%，大大低于使用剂量。目前在兽药市场上出售的黄芪多糖、柴胡、板蓝根、鱼腥草、双黄连、穿心莲、甘草、大青叶等注射液，常有假冒伪劣产品出现。用户选用时要认真看准药品的批准生产文号与生产厂家，以免受骗。
5.中兽药制剂生产严重缺乏相关专业技术人才。中国的兽医学科中有中兽医专业，而没有中兽药专业。现在搞中兽药制剂产品生产的技术人员绝大多数都是学习西药与人医中药专业转移过来的。全国专门研发中兽药制剂的研究机构也很少国家教育部与科技部将中兽医学列为临床兽医学科之下的三级学科，造成当前中兽医学科与中兽药人才严重缺乏、缺技术、缺经费的状况，严重影响到中兽药制剂产品的创新与开发，阻碍了我国畜牧业的持续发展。