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4月11日，中牧股份发布2016年年度报告。报告显示，公司实现营业收入39.48亿元，同比减少6.27%，营业成本27.89亿元，同比减少10.65%。主营业务利润11.58亿元，同比增加6.29%，实现归属于上市公司股东的净利润3.34亿元，同比增加21.31%。营业收入减少主要受贸易业务销售收入同比下降36.76%的影响。
从报表中看出，公司在2016年以生物制品业务为主，占主营收入比例的33.02%，占主营业务利润比例达到60.8%。生物制品收入来源主要是公司市场化口蹄疫疫苗全年收入同比上升75.59%；常规畜用疫苗收入同比上升19.41%；常规禽用疫苗收入同比上升15.01%。生物制品板块全年实现营业收入13.04亿元，同比增长4.46%。
报告显示，2016年公司的化药业务实现快速增长。公司持续开展技术创新，加大科研投入和技改力度，逐步形成核心竞争能力。在饲料业务上也实现了新的发展，公司积极推进营销创新，深入推进数据营销，积极推行驻场营销，不断增强客户黏性，体现公司饲料产品配方的科学性和品牌价值。
公司在报告期内研发投入达2.31亿元，研发投入占营业收入比重为5.83%，高于同行业平均水平。资金主要投入于猪伪狂犬耐热保护剂活疫苗(HB-2000株)的研制和猪圆环病毒2型灭活疫苗(SH 株II)生产转化，投入金额分别是955.43万元和696.42万元，公司研发投入比重合理，能够满足公司未来发展和参与市场竞争的需求。目前公司主推排名前五的药（产）品有猪口蹄疫O型灭活疫苗，口蹄疫O型、亚洲I型二价灭活疫苗，高致病性猪繁殖与呼吸综合征活疫苗，口蹄疫O型、A型、亚洲I型三价灭活疫苗，猪口蹄疫O型合成肽疫苗。
在2017年，公司计划充分利用现代信息技术，尝试打造互联网+服务的商业模式。还将以加快实施股权激励方案和积极稳妥推进所属企业混合所有制改革为契机，探索实现管理层和骨干员工的中长期激励的有效途径。并力争在新技术、新工艺、新产品领域取得突破。
在环保方面，公司高度重视节能环保管理工作，不断完善节能环保三大体系(即组织机构、统计监测体系和考核体系)，完善管理制度，深挖企业节能潜力，严控污染物排放量。年度内，公司及控股子公司全面完成了上级单位和企业所在地政府下达的年度节能环保目标和任务，努力把公司打造成“资源节约、环境友好”型企业，北京华罗积极开展并一次通过了清洁生产体系认证。
通过对各所属企业的能源消费和污染物排放执行常态化监控管理方式，公司完成全年节能环保任务:万元产值综合能耗(可比价)同比减少 18.04%；万元增加值综合能耗(可比价)同比减少50.77%；化学需氧量排放量(COD)排放总量同比减少3.02%。