派森诺助力完成牙鲆转录组测序研究

     派森诺生物与中国水产科学研究院黄海水产研究所莫照兰老师合作，对牙鲆脾脏进行了转录组测序，为免疫相关基因的功能研究提供理论依据。

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     派森诺生物与黄海研究所莫照兰老师携手合作，应用转录组从头测序的方法，对牙鲆脾脏进行了测序，为牙鲆免疫相关基因的研究提供了基础。研究人员莫照兰等关于牙鲆转录组测序的研究成果《De Novo Assembly of the Japanese Flounder (Paralichthys olivaceus) Spleen Transcriptome toIdentify Putative Genes Involved in Immunity》于近期发表在《PLos one》上。

     牙鲆是亚洲重要的海洋经济鱼类，但是近年来由于各种致病菌使牙鲆的养殖受到严重的影响。牙鲆的基因组数据和转录组数据都比较缺乏，这就限制了对牙鲆免疫系统的研究。本研究利用Illumina MiSeq平台首次对牙鲆脾脏进行了转录组测序，共获得了12,196,968 trimmed clean reads。经过软件拼接组装，共得到了96,627 unigenes，其中有21,391 unigenes 在Nr数据库中被注释。

     本研究转录组数据为发现和鉴别牙鲆的新基因提供了丰富的来源，并且鉴别与免疫相关的基因也有助于我们了解免疫应答的机制，为牙鲆免疫机制的研究提供了基础。该研究的高通量测序和信息分析由上海派森诺生物科技有限公司协助完成。
       
     原文索引：

     Lin Huang, Guiyang Li, Zhaolan Mo, Peng Xiao, Jie Li, Jie Huang. De Novo Assembly of the Japanese Flounder (Paralichthys olivaceus) Spleen Transcriptome to Identify Putative Genes Involved in Immunity. PLoS ONE (2015) 10(2): e0117642. doi:10.1371/journal.pone.0117642.

     文章链接：

     http://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0117642

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