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派森诺携手中国科学院海洋研究所共同探究:中华绒螯蟹转录组测序

      派森诺生物与海洋研究所崔朝霞老师携手合作,应用转录组测序方法,首次对进行和未进行脱盐处理的中华绒螯蟹进行转录组测序,并对与渗透调节和压力适应相关基因展开研究,为中华绒螯蟹渗透调节和压力适应机制的研究提供了基础。

      派森诺生物与海洋研究所崔朝霞老师携手合作,应用转录组测序方法,首次对进行和未进行脱盐处理的中华绒螯蟹进行转录水平的研究,为中华绒螯蟹渗透调节和压力适应机制的研究提供了基础。研究人员崔朝霞等关于中华绒螯蟹转录组测序的研究成果《Transcriptome Changes in Eriocheir sinensis Megalopae after Desalination Provide Insights into Osmoregulation and Stress Adaption in Larvae》 于近期发表在《PLos one》上。

      中华绒螯蟹具有重要的经济价值,在它的生命周期中会经历不同的盐度环境,在大眼幼体阶段会经历环境盐度的转变。作者利用Illumina HiSeq平台首次对进行和未进行脱盐处理的中华绒螯蟹进行转录组测序,分别获得58,339,580和56,923,344 clean reads。经过拼接组装,共得到了21,042 Unigenes,(最大长度为22,554 bp , 平均长度为1,635 bp,N50为2,629 bp),发现908个差异表达基因,与能量代谢、翻译、转运等相关。

      通过转录组测序可有效获取中华绒螯蟹的转录本信息,为中华绒螯蟹渗透调节和压力适应机制的研究提供基础 。该研究的高通量测序和信息分析由上海派森诺生物科技有限公司协助完成。
       
       
      原文索引:

      Min Hui, Yuan Liu, Chengwen Song, Yingdong Li, Guohui Shi, Zhaoxia Cui (2014) Transcriptome Changes in Eriocheir sinensis Megalopae after Desalination Provide Insights into Osmoregulation and Stress Adaption in Larvae.PLoS ONE 9(12): e114187. doi:10.1371/ journal.pone.0114187.

​      文章链接:

      http://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0114187

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