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1. A型毒株。全世界A型口蹄疫的流行范围和毒株复杂程度仅次于O型口蹄疫,而其的致病性和抗原变异性则普遍强于O型。从遗传关系分类,全世界A型口蹄疫病毒可分为三个大的遗传拓朴型(topotype),即Eu-SA型(欧洲-南美型)、ASIA型(亚洲型)和Africa型(非洲型),每个型又包含有多个遗传谱系的毒株。我国目前流行A型ASIA拓扑型东南亚-97(Sea-97)毒株。
A型Sea-97毒株在2009年年初经由东南亚国家传入我国,其后在8个省份相继出现病例或病原阳性,2010年以后,我国再未见由该毒株引起的疫情报道,但在国家口蹄疫参考实验室组织的主动监测中发现有阳性带毒畜。该毒株长期流行于东南亚地区,是该地区特有的一个A型流行毒。由于难以追查到有价值的流行病学线索,该A型病毒是何时、以何种方式、通过什么途径传入我国的,目前仍不清楚。参考实验室研制的AF/72疫苗在紧急免疫防疫中发挥了重要作用,同时,参考实验室利用反向疫苗技术克服了A/WH/09毒的繁殖缺陷,构建出了Re-A/WH疫苗毒株,对于今后的防疫有较好的储备。2013年新发A型口蹄疫疫情由同一毒株引起。17次疫情毒株的VP1基因序列同源性在99%以上。其与2009-2010我国湖北、上海等发生的A型毒株的同源性为91%~92%;与我国A型口蹄疫历史毒株的关系更远,仅为76%~78%。其与2009年湖北武汉毒虽然都属于Sea-97毒株,但属于不同的进化分支。我们将2009-2010年湖北武汉等地流行的毒统称为G1分支,将2013年流行的毒株统称为G2分支,以便区别。经WRL-FMD次对分析,在全球范围可查到的与之最高同源毒株为2010~2012年泰国、越南等东南亚国家毒株,同源性在97%以上。根据毒株遗传关系分析结果,结合近年我室开展的A型病原监测结果和国外相关资料,我们认为,此轮新发A型口蹄疫G2毒株来自东南亚,而非由我国国内存在的G1毒株衍化而来。
2. O型口蹄疫流行毒。按遗传分类,我国目前主要流行三种遗传拓扑型(Topotype)的O型口蹄疫病毒,分别属于CATHAY型(中国型)、ME-SA型(中东-南亚型)和SEA型(东南亚型)。
(1)CATHAY型流行毒:“CATHAY”型是国际上对东南亚和中国特有的一个流行毒的称谓,我国参考实验室曾将其称为“猪毒遗传群”。CATHAY型病毒在全世界O型口蹄疫病毒遗传进化树上自成一脉,长期大量的田间流行病学调查发现,CATHAY型病毒主要引起猪发病,牛羊病例很少,但常有带毒现象。2010年以后,未见该毒株在我国引起的发病病例报道,但在重点省份生猪屠宰场监测中仍然发现有带毒阳性。目前,报道主要在香港和东南亚地区流行。其抗原变异性应给予关注。
(2)PanAsia毒株:PanAsia毒株属于ME-SA遗传拓扑型,1990年衍生自印度。该毒传播能力很强,在1999~2001年,曾引起整个亚洲大规模暴发疫情,并远播至非洲和欧洲,震动了全世界。PanAsia毒株在我国引起口蹄疫大流行,造成的经济损失和社会影响巨大,催生了我国强制免疫政策的出台。
(3)Mya98毒株:Mya98毒株曾经称之为耿马毒(GM),该毒属于SEA拓扑型东南亚流行毒。2010年2月之后,我国相继公布了广州白云区等一系列O型口蹄疫疫情,这是继1999年之后间隔10年再次公布O型疫情。流行病学分析表明,Mya98是当前最主要流行毒,尤其是猪Mya-98疫情。2010年我国90%的O型疫情由该毒所致,2011年全国19省监测牛猪中82%的病原阳性为Mya98,说明此状况可能会持续数年,根据免疫动物群体田间发病的实际情况和实验室免疫试验结果,研制针对性疫苗已成必然。2011年3月,用Mya98(GD/BY/2010)毒株为疫苗种毒研制的疫苗已获批准生产,交叉试验证明,该疫苗对目前我国流行的O型所有流行毒代表株都具有良好免疫保护力。
3. Asia1型口蹄疫流行毒。2005~2009年,我国主要流行牛Asia1型口蹄疫,毒株为Asia1/JS/05毒。2009年之后,再未见该毒株流行,也少见阳性带毒。这一趋势与东南亚等国家一致。
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